Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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PtprbB2RU80 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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PtprbB2RU80 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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PtprbB2RU80 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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PtprbB2RU80 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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PtprbB2RU80 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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PtprbB2RU80 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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PtprbB2RU80 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PtprbB2RU80 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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PtprbB2RU80 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprbB2RU80 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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