Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms