Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rrn3B2RS91 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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