Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Uhrf1bp1B2KF50 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms