Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms