Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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