Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd1A2AKB4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms