Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lcn6A2AJB9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lcn6A2AJB9 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lcn6A2AJB9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lcn6A2AJB9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lcn6A2AJB9 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lcn6A2AJB9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lcn6A2AJB9 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lcn6A2AJB9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lcn6A2AJB9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lcn6A2AJB9 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Lcn6A2AJB9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lcn6A2AJB9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lcn6A2AJB9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lcn6A2AJB9 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lcn6A2AJB9 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lcn6A2AJB9 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Lcn6A2AJB9 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Lcn6A2AJB9 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Lcn6A2AJB9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lcn6A2AJB9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Lcn6A2AJB9 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lcn6A2AJB9 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lcn6A2AJB9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lcn6A2AJB9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lcn6A2AJB9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lcn6A2AJB9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lcn6A2AJB9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lcn6A2AJB9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lcn6A2AJB9 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lcn6A2AJB9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lcn6A2AJB9 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lcn6A2AJB9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lcn6A2AJB9 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lcn6A2AJB9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lcn6A2AJB9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lcn6A2AJB9 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lcn6A2AJB9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lcn6A2AJB9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lcn6A2AJB9 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lcn6A2AJB9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lcn6A2AJB9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lcn6A2AJB9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lcn6A2AJB9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms