Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms