Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1lA2A5N3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc1lA2A5N3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms