Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
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Ilf3Q9Z1X4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms