Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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Nfe2l3Q9WTM4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Nfe2l3Q9WTM4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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Nfe2l3Q9WTM4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfe2l3Q9WTM4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms