Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PplQ9R269 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PplQ9R269 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PplQ9R269 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PplQ9R269 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PplQ9R269 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PplQ9R269 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms