Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prkab1Q9R078 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkab1Q9R078 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkab1Q9R078 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkab1Q9R078 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkab1Q9R078 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkab1Q9R078 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkab1Q9R078 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkab1Q9R078 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkab1Q9R078 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkab1Q9R078 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkab1Q9R078 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkab1Q9R078 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkab1Q9R078 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkab1Q9R078 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkab1Q9R078 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkab1Q9R078 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkab1Q9R078 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkab1Q9R078 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkab1Q9R078 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkab1Q9R078 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkab1Q9R078 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkab1Q9R078 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkab1Q9R078 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkab1Q9R078 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkab1Q9R078 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkab1Q9R078 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prkab1Q9R078 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkab1Q9R078 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkab1Q9R078 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkab1Q9R078 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkab1Q9R078 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkab1Q9R078 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkab1Q9R078 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkab1Q9R078 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkab1Q9R078 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prkab1Q9R078 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms