Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms