Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms