Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms