Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc2lQ9JME7 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms