Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

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Length 756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dclk1Q9JLM8 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms