Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Tgm1Q9JLF6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Tgm1Q9JLF6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Tgm1Q9JLF6 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Tgm1Q9JLF6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Tgm1Q9JLF6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Tgm1Q9JLF6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Tgm1Q9JLF6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Tgm1Q9JLF6 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Tgm1Q9JLF6 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Tgm1Q9JLF6 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Tgm1Q9JLF6 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Tgm1Q9JLF6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgm1Q9JLF6 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms