Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Prg3Q9JL95 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Prg3Q9JL95 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Prg3Q9JL95 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Prg3Q9JL95 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Prg3Q9JL95 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg3Q9JL95 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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