Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Gde1Q9JL56 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Gde1Q9JL56 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Gde1Q9JL56 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Gde1Q9JL56 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Gde1Q9JL56 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Gde1Q9JL56 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Gde1Q9JL56 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Gde1Q9JL56 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Gde1Q9JL56 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Gde1Q9JL56 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Gde1Q9JL56 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Gde1Q9JL56 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Gde1Q9JL56 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gde1Q9JL56 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms