Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
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Rb1cc1Q9ESK9 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
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Rb1cc1Q9ESK9 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rb1cc1Q9ESK9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
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Rb1cc1Q9ESK9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
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Rb1cc1Q9ESK9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
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