Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clstn2Q9ER65 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clstn2Q9ER65 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clstn2Q9ER65 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Clstn2Q9ER65 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clstn2Q9ER65 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clstn2Q9ER65 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Clstn2Q9ER65 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Clstn2Q9ER65 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Clstn2Q9ER65 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Clstn2Q9ER65 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Clstn2Q9ER65 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Clstn2Q9ER65 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Clstn2Q9ER65 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.5 ms