Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Med27Q9DB40 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms