Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Cnn3Q9DAW9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cnn3Q9DAW9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms