Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gtf3c6Q9D8P7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gtf3c6Q9D8P7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gtf3c6Q9D8P7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gtf3c6Q9D8P7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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