Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms