Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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