Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Tubgcp4Q9D4F8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Tubgcp4Q9D4F8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Tubgcp4Q9D4F8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Tubgcp4Q9D4F8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Tubgcp4Q9D4F8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Tubgcp4Q9D4F8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Tubgcp4Q9D4F8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Tubgcp4Q9D4F8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Tubgcp4Q9D4F8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Tubgcp4Q9D4F8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Tubgcp4Q9D4F8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Tubgcp4Q9D4F8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Tubgcp4Q9D4F8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Tubgcp4Q9D4F8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Tubgcp4Q9D4F8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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