Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms