Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms