Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syf2Q9D198 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms