Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Xrcc3Q9CXE6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Xrcc3Q9CXE6 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Xrcc3Q9CXE6 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Xrcc3Q9CXE6 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Xrcc3Q9CXE6 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Xrcc3Q9CXE6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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