Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms