Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhobtb3Q9CTN4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms