Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
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Nicn1Q9CQM0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Nicn1Q9CQM0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Nicn1Q9CQM0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Nicn1Q9CQM0 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Nicn1Q9CQM0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Nicn1Q9CQM0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Nicn1Q9CQM0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Nicn1Q9CQM0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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