Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms