Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed6Q9CQG0 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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