Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms