Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nsmce3Q9CPR8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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