Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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