Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntnap4Q99P47 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms