Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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PtprtQ99M80 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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PtprtQ99M80 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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PtprtQ99M80 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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PtprtQ99M80 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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PtprtQ99M80 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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PtprtQ99M80 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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PtprtQ99M80 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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