Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ufsp2Q99K23 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ufsp2Q99K23 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms