Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TirapQ99JY1 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms