Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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Smim11aQ99J19 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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Smim11aQ99J19 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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