Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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