Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfdQ925I7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfdQ925I7 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms