Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Rnf144aQ925F3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Rnf144aQ925F3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Rnf144aQ925F3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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